《大宋·京都巡异志》讲述了北宋年间，东京汴梁城内发生的一系列离奇案件。故事以开封府尹赵祯（并非历史上那位皇帝，而是虚构人物）的亲信，年轻有为的捕快苏文彦为主角展开。苏文彦并非寻常的武夫，他精通刑侦，善于观察，更重要的是，他拥有着敏锐的感知能力，能够察觉到常人难以发现的细微之处，甚至能隐隐感知到某些超自然现象。

故事伊始，汴梁城内接连发生几起怪异命案：死者皆死状凄惨，且现场留有无法解释的奇异痕迹。开封府上下束手无策，案件牵涉甚广，甚至惊动了皇室。赵祯看重苏文彦的才能，委以重任，让他秘密调查这些案件，并赋予了他超越寻常捕快的权限。

苏文彦在调查过程中，结识了同样拥有特殊能力的女子——医术高明的女仵作柳惜颜。柳惜颜不仅能够从尸体上发现常人无法察觉的细节，更能通过一些特殊的草药和仪式，辅助苏文彦破案。两人互补互助，成为了最佳拍档。他们一起探访了汴梁城的大街小巷，从繁华的瓦舍勾栏到阴森的古寺庙宇，逐渐揭开了一层层迷雾。

案件的线索指向了隐藏在汴梁城下的一个古老神秘组织——“玄冥教”。该教徒奉行神秘的仪式，利用奇门遁甲之术和一些不可名状的力量作恶。他们的目的并非简单的杀人越货，而是试图通过某种仪式，唤醒沉睡在汴梁城地底下的古老邪祟，以达到不可告人的目的。

随着调查的深入，苏文彦和柳惜颜遭遇了越来越多的危险和挑战。他们不仅要面对玄冥教的追杀和阴谋诡计，还要与城内权贵势力的暗中阻挠作斗争。一些看似无关紧要的小人物，例如一位沉默寡言的算命先生、一位技艺精湛的工匠、一位饱经沧桑的老道士，都在不知不觉中与案件有着千丝万缕的联系，他们的身份和秘密也逐渐被揭开。

在调查过程中，苏文彦和柳惜颜逐渐发现，玄冥教的仪式与汴梁城古老的历史传说有着密切的联系。传说中，汴梁城下封印着一条上古凶兽，而玄冥教试图利用仪式解开封印，释放凶兽，从而掌控汴梁城乃至天下。

最终，苏文彦和柳惜颜凭借着他们的智慧、勇气和特殊的感知能力，揭露了玄冥教的阴谋，阻止了他们唤醒上古凶兽的计划。在与玄冥教首领的最终对决中，他们不仅展现了高超的武艺和侦探技巧，更展现了他们坚定的正义感和对百姓的责任心。这场惊心动魄的斗争，也让他们对汴梁城、对人性的善恶有了更深刻的认识。

故事并非简单的善恶对立，而是展现了人性的复杂性和社会的多面性。一些看似邪恶的人物，背后也隐藏着不为人知的苦衷；而一些看似正直的人，也可能隐藏着不可告人的秘密。最终，正义战胜了邪恶，汴梁城恢复了平静，但苏文彦和柳惜颜的故事并未结束，他们将继续守护着这座繁华的都市，继续守护着这片土地上的安宁。剧集的结尾，留下了些许悬念，暗示着更深层次的谜团和更大的挑战在等待着他们。而汴梁城下，那古老的秘密，似乎也并未完全被揭开……