分隔在两个世界的爱力克兄弟二人，使用各自的手段尝试着兄弟再会。 哥哥爱德华穿过“门”来到真实世界。公元1923年的德国慕尼黑，一场世界大战即将到来。无法在这个世界使用炼金术的爱德华，与长相酷似弟弟的青年爱尔凡斯一起研究火箭的科技，希望借助火箭回到原来的世界。另一边的炼金术世界，弟弟阿尔冯斯修行炼金术，打扮宛若曾经的爱德华，与国家炼金术士们一起寻找找回哥哥的方法。 而暗地中，慕尼黑的一个神秘组织开始了寻找理想国“香巴拉”的仪式，连接炼金术世界与现实世界的“门”被打开了。 兄弟二人的命运与两个世界的危机交织在一起，爱力克兄弟要面对前所未有的挑战。

《钢之炼金术师：香巴拉的征服者》是根据同名漫画改编的剧场版动画电影，并非对原作漫画的完全忠实改编，而是一个平行于原作故事的“另一种可能性”。它在剧情上与原作漫画后期有部分关联，但结局却完全不同，为爱德华·艾尔利克兄弟的旅程提供了另一种诠释。

电影的故事发生在原作漫画故事的后期。爱德华和阿尔冯斯在寻找贤者之石的旅途中，意外地发现了一个通往另一个世界的入口——通往类似于1920年代欧洲的平行世界“香巴拉”的裂缝。这个世界的技术水平远超艾尔利克兄弟所在的Amestris世界，拥有先进的机械和强大的力量。

在香巴拉世界，爱德华遇见了与自己长相几乎一样的青年——“肖尔·艾尔利克”，他是这个世界的炼金术师，也是一个拥有相当地位的军官，生活在一个看似和平，却暗藏危机与秘密的社会里。肖尔拥有着和爱德华相似的经历，但命运却截然不同。他拥有着更强大的力量，却也背负着沉重的责任和痛苦的记忆。

爱德华一开始被肖尔的存在所震惊，并试图寻找回家的方法。他逐渐发现香巴拉世界的繁荣和进步背后隐藏着巨大的秘密，以及一个与Amestris世界有着千丝万缕联系的阴谋。这个秘密关系到两个世界的平衡，以及一种被称为“人造人”的存在，它们被创造出来执行某种黑暗目的。

随着剧情的发展，爱德华发现肖尔与人造人的秘密计划有关，这个计划将彻底改变两个世界，甚至可能导致Amestris世界的毁灭。肖尔利用自己的知识和能力，试图维持香巴拉世界的稳定，但他内心深处也渴望了解自己的过去，以及自己与爱德华之间的联系。他并不邪恶，而是被困在了一个他难以摆脱的困境中。

阿尔冯斯在另一个世界则面临着不同的挑战。他必须在两个世界之间寻找平衡点，同时也要面对自己身份的认同问题。他不仅要帮助哥哥，还要保护自己和哥哥的安危。

最终，爱德华必须做出一个艰难的选择：是帮助肖尔维持香巴拉世界的稳定，还是破坏这个计划，保护自己的世界，即使这将意味着打破两个世界的平衡。他面临着道德和伦理的挑战，需要在两个世界之间找到一个平衡点。

电影的结局并没有一个简单的善恶对决，而是一个充满悲壮色彩的结局。爱德华最终选择了牺牲自己，为了保护Amestris世界，也为了帮助肖尔找到自我救赎的道路。他选择了独自承受一切，将两个世界的命运交托给未来。

总而言之，《钢之炼金术师：香巴拉的征服者》并非一个简单的冒险故事，而是一个关于选择、牺牲、以及寻找自我认同的深刻故事。它探讨了科技与人性的冲突，以及个体与世界的关系，并通过平行世界的故事，展现了不同选择的不同后果。虽然与原作漫画的剧情有出入，但它为钢炼的故事增添了另一种独特的魅力和思考维度，留给观众深刻的印象和无尽的回味。电影也对“炼金术”的本质进行了更深层次的探讨，呈现了在不同世界下，相同理论的不同应用方式和结果。