将少林寺视为眼中钉的清廷利用安插在少林寺中的奸细提供的情报，调遣了各路高手火烧少林寺，处心积虑地想一举消灭少林子弟。事出突然，寺中僧人及俗家弟子仓促应战一番后十死其九。　　捡得性命的方大洪（孟飞）逃向广东与李式开（戚冠军）会合，商议如何继续反清复明。而胡德帝（姜大卫）、蔡德忠（狄龙）、马超兴（傅声）等人则北上中原，千方百计查找寺中内奸，决意为死去的少林弟子报仇。——五人一度对少林功夫有所怀疑，后来才醒悟怪不得少林功夫，只怨自己学艺不精，于是潜心修炼终成正果，被后世称为“少林五祖”。

第一章：少林灭门之祸

清朝末年，少林寺因遭人陷害，惨遭灭门之难。方世玉、洪熙官、李世杰、冯道德和胡惠乾五人侥幸逃脱，誓要为少林报仇雪恨。

第二章：结拜五兄弟

五人逃难途中偶遇红花会总舵主陈家洛，在陈家洛的帮助下，结拜为异姓兄弟。他们潜伏于江湖之中，收集证据，查找灭门凶手。

第三章：追查线索

经过一番调查，五人发现灭门惨案与朝廷奸臣鳌拜有关。鳌拜勾结满清鞑子，企图颠覆清朝，少林寺的灭亡只是一个阴谋的开端。

第四章：少林武功散落

少林寺灭门后，寺内失传已久的武功秘籍也散落江湖。方世玉、洪熙官等人四处寻找，誓要将少林武功重现于世。

第五章：血战清军

五兄弟在追查线索的过程中遭到清军的追杀。他们施展少林绝技，与清军展开激烈的战斗，誓死捍卫汉民族的尊严。

第六章：鳌拜阴谋初现

鳌拜的阴谋逐渐显露，他利用权势陷害忠良，排挤异己，企图控制朝廷。五兄弟意识到鳌拜的危害，决定全力阻止他的阴谋。

第七章：陈家洛相助

红花会得知五兄弟的遭遇，鼎力相助。陈家洛率领红花会众兄弟与五兄弟联手，打击清廷势力，解救被鳌拜囚禁的忠臣良将。

第八章：群雄集结

五兄弟的抗清行动吸引了各路侠客的加入。丐帮长老洪安通、武当掌门冲虚道长等武林高手纷纷相助，共同对抗清廷的暴政。

第九章：鳌拜身败名裂

经过一番激烈的战斗，五兄弟和群雄联手将鳌拜及其党羽绳之以法。鳌拜的阴谋被挫败，清廷的统治得到稳固。

第十章：少林重振

少林寺灭门惨案的真相大白，五兄弟收集到失散的武功秘籍，将少林武功重新振兴。少林寺成为武林圣地，继续传承中华武术文化。

人物简介

方世玉：少林五祖之首，武艺高强，志向远大。

洪熙官：方世玉的结拜兄弟，精通洪拳，义薄云天。

李世杰：方世玉的结拜兄弟，身怀醉拳绝技，为人豪爽。

冯道德：方世玉的结拜兄弟，擅长轻功，机警敏捷。

胡惠乾：方世玉的结拜兄弟，武艺平平，但为人忠厚老实。

陈家洛：红花会总舵主，足智多谋，武艺高强。